中药化学是在中医药理论指导下，结合临床用药经验，充分利用物理、化学、色谱、光谱等现代技术，研究中药中化学成分和组成，揭示中药作用物质基础的重要学科；是中药研究领域中的重要基础学科之一，深度渗透于其它中药相关的学科，是中药现代化和标准化的必备学科。中药化学是中药领域的中药基础学科之一，其外延涉及中药化学鉴定、中药炮制化学、中药质量标准、中药制药、中药提取物制备、中药药理等相关学科。

我校中药学专业建设始建于1960年。2006年学校升级为专科后带动中药化学学科不断发展,学校从人才队伍、研究平台、科研项目、制度保障等方面大力支持中药化学重点学科建设。近年来引进硕士及以上研究生10人（其中博士2人），送培研究生5人，其中博士后1人，不断提升学科研究水平。学校建设了“川西北中药材资源研究与开发利用实验室”，四川省军民融合研究院中医药分院，建设了140平米的中药材培育温室，购置了液相色谱质谱分析仪器、原子吸收光谱分析仪、紫外可见分光光度计、超临界萃取装置、多功能荧光显微镜、冷冻干燥机等大型精密分析仪器及配套设施，总价值超过1000万元；学校每年专门设立专门项目，支持中药化学相关课题的研究，并建立了系列保障制度，促进中药化学学科建设。2013年列为学校重点建设的学科；2016年建成绵阳市重点学科。该学科与德培元、好医生药业、科伦制药等公司建立深入的合作关系，在绵阳市、四川省中药材产业发展方面发挥了积极促进作用。中药学专业为四川省重点专业建设，列为学校重点学科建设培养。 经过多年的建设，本学科形成了4个成熟稳定的研究方向：中药道地药材资源有效组分开发利用研究、中药材的分子光谱研究、中药抗氧化活性成分研究、中药制剂质量标准研究。

本学科现有专任教师29人，其中教授5人，副教授10人，讲师12人，助教2人。近5年来，本学科发表论文60余篇，主编教材（专著）30余部，完成厅局级以上科研项目30余项，总经费达300多万元。学科科研重点集中于中药道地药材资源有效组分利用、中药材质量分析与评价研究、中药制剂质量标准、中药抗氧化活性研究和应用研究，在中药生产与加工、药品生产技术、药品质量与安全等专业建设中发展发挥了领军作用。